MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrobacter hamburgensis X14 plasmid 3

Total Repeats: 2095

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007961	CCGT	2	8	116	123	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
2	NC_007961	CGG	2	6	166	171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
3	NC_007961	CGG	2	6	186	191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
4	NC_007961	GC	3	6	204	209	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
5	NC_007961	CGAGGC	2	12	220	231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	92109664
6	NC_007961	GC	3	6	230	235	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
7	NC_007961	GTC	2	6	236	241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
8	NC_007961	CAA	2	6	250	255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109664
9	NC_007961	TGC	2	6	282	287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
10	NC_007961	CCGA	2	8	324	331	25 %	0 %	25 %	50 %	92109664
11	NC_007961	ATC	2	6	416	421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109664
12	NC_007961	CG	3	6	441	446	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
13	NC_007961	GC	3	6	466	471	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
14	NC_007961	CG	3	6	495	500	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
15	NC_007961	TGA	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109664
16	NC_007961	AAG	2	6	599	604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
17	NC_007961	AGCG	2	8	702	709	25 %	0 %	50 %	25 %	92109664
18	NC_007961	GATC	2	8	715	722	25 %	25 %	25 %	25 %	92109664
19	NC_007961	ACC	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109664
20	NC_007961	GGC	2	6	866	871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
21	NC_007961	GAA	2	6	902	907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
22	NC_007961	CGCC	2	8	922	929	0 %	0 %	25 %	75 %	92109664
23	NC_007961	CGA	2	6	988	993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
24	NC_007961	TGC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
25	NC_007961	CGA	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
26	NC_007961	GC	3	6	1136	1141	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
27	NC_007961	CG	3	6	1187	1192	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
28	NC_007961	TC	3	6	1198	1203	0 %	50 %	0 %	50 %	92109664
29	NC_007961	CGTC	2	8	1230	1237	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
30	NC_007961	CG	3	6	1252	1257	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
31	NC_007961	CCG	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
32	NC_007961	GTC	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
33	NC_007961	CGG	2	6	1323	1328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
34	NC_007961	TCG	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
35	NC_007961	CGCCGG	2	12	1339	1350	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
36	NC_007961	GAT	2	6	1360	1365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109664
37	NC_007961	GCGG	2	8	1366	1373	0 %	0 %	75 %	25 %	92109664
38	NC_007961	CGG	2	6	1411	1416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
39	NC_007961	GGC	2	6	1432	1437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
40	NC_007961	GAAG	2	8	1450	1457	50 %	0 %	50 %	0 %	92109664
41	NC_007961	CGC	2	6	1465	1470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
42	NC_007961	CCT	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109664
43	NC_007961	GAA	2	6	1501	1506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
44	NC_007961	GAT	2	6	1514	1519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109664
45	NC_007961	CGA	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
46	NC_007961	TGG	2	6	1560	1565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109664
47	NC_007961	AGC	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
48	NC_007961	GCG	2	6	1667	1672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
49	NC_007961	TCG	2	6	1683	1688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
50	NC_007961	CTCG	2	8	1753	1760	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
51	NC_007961	CG	4	8	1765	1772	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
52	NC_007961	CG	3	6	1931	1936	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
53	NC_007961	TCG	2	6	1962	1967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
54	NC_007961	TCG	2	6	1977	1982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
55	NC_007961	CGGAA	2	10	1999	2008	40 %	0 %	40 %	20 %	92109664
56	NC_007961	GCG	2	6	2017	2022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
57	NC_007961	TCT	2	6	2046	2051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	92109664
58	NC_007961	GAA	2	6	2053	2058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
59	NC_007961	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
60	NC_007961	CGC	2	6	2107	2112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
61	NC_007961	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
62	NC_007961	CCG	3	9	2164	2172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
63	NC_007961	AGC	2	6	2184	2189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
64	NC_007961	CGA	2	6	2220	2225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
65	NC_007961	CTCG	2	8	2281	2288	0 %	25 %	25 %	50 %	92109664
66	NC_007961	GAG	2	6	2327	2332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109664
67	NC_007961	CGGC	2	8	2347	2354	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
68	NC_007961	CG	3	6	2402	2407	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
69	NC_007961	GCG	2	6	2433	2438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
70	NC_007961	TGCGC	2	10	2452	2461	0 %	20 %	40 %	40 %	92109664
71	NC_007961	CGC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
72	NC_007961	TCA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109664
73	NC_007961	CCG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
74	NC_007961	AGC	2	6	2544	2549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
75	NC_007961	TGG	2	6	2553	2558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109664
76	NC_007961	GCC	2	6	2565	2570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
77	NC_007961	GC	4	8	2575	2582	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
78	NC_007961	TCA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109664
79	NC_007961	CG	3	6	2632	2637	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
80	NC_007961	AGG	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109664
81	NC_007961	AAG	2	6	2732	2737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	92109664
82	NC_007961	AGG	2	6	2745	2750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109664
83	NC_007961	GC	3	6	2788	2793	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
84	NC_007961	CCG	3	9	2832	2840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
85	NC_007961	CGA	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
86	NC_007961	CAG	2	6	2855	2860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
87	NC_007961	CGC	2	6	2863	2868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109664
88	NC_007961	CTG	2	6	2909	2914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109664
89	NC_007961	GAG	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109664
90	NC_007961	GC	3	6	3144	3149	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
91	NC_007961	CAA	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	92109664
92	NC_007961	GGC	2	6	3283	3288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109664
93	NC_007961	GC	3	6	3305	3310	0 %	0 %	50 %	50 %	92109664
94	NC_007961	AGC	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109664
95	NC_007961	GAAG	2	8	3322	3329	50 %	0 %	50 %	0 %	92109664
96	NC_007961	GCACA	2	10	3345	3354	40 %	0 %	20 %	40 %	92109664
97	NC_007961	ATG	2	6	3413	3418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109664
98	NC_007961	CT	3	6	3456	3461	0 %	50 %	0 %	50 %	92109665
99	NC_007961	CCGGCG	2	12	3479	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
100	NC_007961	CTGG	2	8	3512	3519	0 %	25 %	50 %	25 %	92109665
101	NC_007961	CG	3	6	3557	3562	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
102	NC_007961	CGGC	2	8	3589	3596	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
103	NC_007961	CG	3	6	3649	3654	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
104	NC_007961	AT	3	6	3666	3671	50 %	50 %	0 %	0 %	92109665
105	NC_007961	CGG	2	6	3690	3695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109665
106	NC_007961	TCA	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	92109665
107	NC_007961	CGG	2	6	3729	3734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109665
108	NC_007961	CAG	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109665
109	NC_007961	GC	3	6	3754	3759	0 %	0 %	50 %	50 %	92109665
110	NC_007961	TCGA	2	8	3763	3770	25 %	25 %	25 %	25 %	92109665
111	NC_007961	GCC	2	6	3811	3816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109665
112	NC_007961	GCG	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109665
113	NC_007961	CCG	2	6	3854	3859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109665
114	NC_007961	GCCCG	2	10	3946	3955	0 %	0 %	40 %	60 %	92109665
115	NC_007961	TGG	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109666
116	NC_007961	CCG	2	6	4002	4007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
117	NC_007961	CTCGGC	2	12	4102	4113	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	92109666
118	NC_007961	GGC	2	6	4138	4143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109666
119	NC_007961	CG	3	6	4146	4151	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
120	NC_007961	CGT	2	6	4165	4170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109666
121	NC_007961	CT	3	6	4206	4211	0 %	50 %	0 %	50 %	92109666
122	NC_007961	GCC	3	9	4223	4231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
123	NC_007961	TTCG	2	8	4288	4295	0 %	50 %	25 %	25 %	92109666
124	NC_007961	TGA	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	92109666
125	NC_007961	GCC	2	6	4321	4326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
126	NC_007961	CGG	2	6	4359	4364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109666
127	NC_007961	TGG	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	92109666
128	NC_007961	GGC	2	6	4402	4407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109666
129	NC_007961	CCG	3	9	4410	4418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
130	NC_007961	TCC	2	6	4419	4424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	92109666
131	NC_007961	CCA	2	6	4425	4430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109666
132	NC_007961	GAC	2	6	4432	4437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	92109666
133	NC_007961	CCG	2	6	4514	4519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
134	NC_007961	GC	3	6	4554	4559	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
135	NC_007961	GCC	2	6	4563	4568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109666
136	NC_007961	TGC	2	6	4644	4649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	92109666
137	NC_007961	GCG	2	6	4658	4663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109666
138	NC_007961	ACC	2	6	4679	4684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	92109666
139	NC_007961	CGCGG	2	10	4709	4718	0 %	0 %	60 %	40 %	92109666
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142	NC_007961	CG	5	10	4796	4805	0 %	0 %	50 %	50 %	92109666
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173	NC_007961	GCC	2	6	7393	7398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109668
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392	NC_007961	GCG	2	6	19561	19566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	92109684
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402	NC_007961	AGG	2	6	19906	19911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	92109684
403	NC_007961	ACAT	2	8	19915	19922	50 %	25 %	0 %	25 %	92109684
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405	NC_007961	CGC	2	6	19947	19952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	92109684
406	NC_007961	CGAG	2	8	19955	19962	25 %	0 %	50 %	25 %	92109684
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